Практически у всех племен индейцев Северной Америки мужские мокасины достаточно сильно отличались от женских. Все мужские образцы этой обуви имели достаточно низкий верх, позволяющий легко передвигаться, не сковывая при этом голени (исключение составляет лишь племена Юго-запада). Это было связано с тем, что мужчины, как правило, занимались охотой и нуждались в удобной обуви, позволяющей преодолевать большие расстояния, не сильно утруждая при этом ноги.
Все женские мокасины имели высокий верх и зачастую, соединялись с гетрами, образовывая подобие сапог с высоким голенищем или ботфорт. Гетры имели по бокам ряды пуговиц или шнуровку, которые помимо декоративных целей служили для застегивания боковой части мокасин и позволяли более удобно подогнать верх ноге.
Кроме того одним из наиглавнейших отличий женских и мужских мокасин было количества декора на них. Мужские мокасины практически не украшались (исключение — наличие бахромы в районе пятки, предназначенной для заметания следов, у некоторых племен). Женские же — наоборот сочетали в себе различные элементы декорирования обуви, в соответствии с возможностями и традициями племени.